Eesti Teadusagentuuri tegevused peavad silmas seitsme peamise sihtrühma huve.
- Nõustame teadlasi ja pakume neile toetusi uurimisprojektide läbiviimiseks ning enesetäiendamiseks.
- Toetame teadus- ja riigiasutusi teadustööga seotud personali palkamisel, rakendusuuringute tellimisel ning korraldamisel.
- Üliõpilasi ootame osalema üliõpilaste teadustööde ja haridusteaduslike tööde riiklikul konkursil
- Kooliõpilasi ootame osalema õpilaste teadustööde ja õpilasleiutajate konkursil ning õpilaste teadusfestivalil. Karjäärivalikul abistavad noori teadusportaal miks.ee ning Inseneeria puu.
- Õpetajatele pakume enesetäiendamisvõimalusi ja õppematerjale sh teadushuvihariduses
- Ettevõtjad saavad tuge, et nutika spetsialiseerumise valdkondades teha koostööd teadlastega. Samuti kutsume ettevõtjad panustama koolihariduse mitmekesistamisse, tutvustades koostöövõimalusi.
- Toetame ja tunnustame teaduse populariseerijaid, et tublidel Eesti teadlastel ja õpetajatel oleks järelkasvu ning ühiskonnas leviks teaduspõhine mõtteviis.