Eesti Teadusagentuur korraldab teadus- ja arendustegevuse evalveerimist ja temaatilist hindamist.

Evalveerimine on välishindamine, mille käigus hinnatakse teadus- ja arendusasutuse vastava valdkonna taset võrreldes valdkonna rahvusvahelise tasemega. Välishindamine omakorda tähendab, et juriidilise isiku või asutuse poolt koostatud enesehinnangu raporti ja/või asutuse külastuse tulemusena annab hinnangu juriidilise isiku või asutuse TA tegevusele asutuse välistest ekspertidest moodustatud hindamiskomisjon.

Temaatilise hindamise eesmärk on hinnata teadus- ja arendustegevuse taset ning korralduslikke aspekte, et toetada teaduspoliitiliste otsuste ja meetmete kujundamist või hinnata nende mõju ja rakendamist ning anda TA-asutustele, ülikoolidele ja rakenduskõrgkoolidele tagasisidet.